Ai fini della tutela della salute dei consumatori, degli utilizzatori, degli astanti e di tutti gli operatori che lavorano con i prodotti fitosanitari devono essere effettuati i controlli sull'immissione in commercio ed uso dei prodotti fitosanitari e per la direttiva sull'uso sostenibile dei prodotti fitosanitari ai sensi dell'articolo 24 del regolamento 625/2017 e dell'articolo 68 del regolamento 1107/2009. Lo stesso regolamento che è stato poi trasposto nella legislazione nazionale con il D.Lgs. n 27/2021 prevede inoltre l'obbligo di rendicontazione per cui i risultati dei controlli oltre che programmati, eseguiti e valutati devono essere raccolti dall'autorità competente e devono essere trasmessi alla Commissione Europea entro il 31 agosto dell'anno successivo ai controlli, infine lo stesso regolamento prevede che i risultati dei controlli al fine del miglioramento continuo siano resi pubblici per l'obbligo di trasparenza Al fine di ottemperare a tali obblighi e per avere risultati omogenei vengono raccolte tali informazioni con formati standardizzati
Ai fini di ottemperare ai contenuti dell'articolo 68 del regolamento 1107/2009 e all'articolo 24 del regolamento 625/2017 vengono pianificati e programmati a livello nazionale dal Ministero della salute i controlli sull'immissione in commercio ed uso dei prodotti fitosanitari. A loro volta gli Assessorati alla Sanità delle regioni programmano le attività di controllo a livello regionale mentre le Aziende Sanitarie Locali eseguono le ispezioni sugli operatori dei prodotti fitosanitari e i campionamenti dei prodotti fitosanitari. Le altre Autorità (Comando Carabinieri per la tutela della salute, Ispettorato per la tutela dei prodotti agroalimentari e per la repressione delle frodi, gli organismi pagatori) nell'ambito delle loro competenze eseguono anche controlli sul territorio. Vengono verificati requisiti delle strutture che contengono i fitosanitari presso gli operatori dei prodotti fitosanitari, dei prodotti anche attraverso i campionamenti, delle etichette, vengono verificate le condizioni di autorizzazione dei prodotti contenute nei decreti di autorizzazione vengono verificate le condizioni di utilizzo sempre riportate sulle etichette
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